Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC46Q96FV0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC46Q96FV0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC46Q96FV0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC46Q96FV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms