Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM143Q96AN5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM143Q96AN5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM143Q96AN5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM143Q96AN5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM143Q96AN5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms