Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6V1E2Q96A05 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6V1E2Q96A05 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP6V1E2Q96A05 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms