Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP13Q92995 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP13Q92995 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP13Q92995 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP13Q92995 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP13Q92995 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP13Q92995 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP13Q92995 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP13Q92995 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP13Q92995 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP13Q92995 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP13Q92995 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP13Q92995 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP13Q92995 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP13Q92995 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP13Q92995 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP13Q92995 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP13Q92995 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP13Q92995 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP13Q92995 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP13Q92995 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP13Q92995 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP13Q92995 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP13Q92995 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP13Q92995 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP13Q92995 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP13Q92995 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP13Q92995 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP13Q92995 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP13Q92995 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP13Q92995 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP13Q92995 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP13Q92995 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP13Q92995 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP13Q92995 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP13Q92995 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP13Q92995 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP13Q92995 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP13Q92995 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP13Q92995 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP13Q92995 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP13Q92995 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP13Q92995 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP13Q92995 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP13Q92995 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP13Q92995 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP13Q92995 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP13Q92995 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP13Q92995 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP13Q92995 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP13Q92995 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP13Q92995 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP13Q92995 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP13Q92995 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP13Q92995 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP13Q92995 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP13Q92995 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP13Q92995 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP13Q92995 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP13Q92995 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP13Q92995 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP13Q92995 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP13Q92995 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP13Q92995 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP13Q92995 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP13Q92995 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP13Q92995 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP13Q92995 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP13Q92995 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP13Q92995 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP13Q92995 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP13Q92995 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP13Q92995 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP13Q92995 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP13Q92995 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP13Q92995 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP13Q92995 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP13Q92995 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP13Q92995 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP13Q92995 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP13Q92995 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP13Q92995 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP13Q92995 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP13Q92995 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP13Q92995 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP13Q92995 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP13Q92995 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP13Q92995 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP13Q92995 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP13Q92995 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP13Q92995 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP13Q92995 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms