Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EDEM1Q92611 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDEM1Q92611 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDEM1Q92611 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EDEM1Q92611 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EDEM1Q92611 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDEM1Q92611 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EDEM1Q92611 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms