Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGB4Q8WW32 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB4Q8WW32 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGB4Q8WW32 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB4Q8WW32 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms