Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK9Q8TD19 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK9Q8TD19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK9Q8TD19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK9Q8TD19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK9Q8TD19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms