Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMYD1Q8NB12 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMYD1Q8NB12 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD1Q8NB12 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD1Q8NB12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms