Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM99Q8N816 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM99Q8N816 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM99Q8N816 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM99Q8N816 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms