Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA13Q8N1Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CA13Q8N1Q1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CA13Q8N1Q1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CA13Q8N1Q1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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