Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHISA5Q8N114 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHISA5Q8N114 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA5Q8N114 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA5Q8N114 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms