Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
P3H3Q8IVL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
P3H3Q8IVL6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4.01
P3H3Q8IVL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.06■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.05■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.02■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
P3H3Q8IVL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
P3H3Q8IVL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
P3H3Q8IVL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms