Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Acbd3Q8BMP6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Acbd3Q8BMP6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acbd3Q8BMP6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acbd3Q8BMP6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms