Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY4Q6ZNE9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RUFY4Q6ZNE9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RUFY4Q6ZNE9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RUFY4Q6ZNE9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
RUFY4Q6ZNE9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms