Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C16orf54Q6UWD8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C16orf54Q6UWD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms