Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN12LQ6IEE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLFN12LQ6IEE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLFN12LQ6IEE8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN12LQ6IEE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms