Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
VIRMAQ69YN4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
VIRMAQ69YN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
VIRMAQ69YN4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
VIRMAQ69YN4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
VIRMAQ69YN4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms