Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf135Q5VTT2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf135Q5VTT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf135Q5VTT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf135Q5VTT2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms