Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDSS1Q5T2R2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDSS1Q5T2R2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDSS1Q5T2R2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDSS1Q5T2R2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms