Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYTL3Q4VX76 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYTL3Q4VX76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYTL3Q4VX76 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYTL3Q4VX76 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms