Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3AQ16821 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP1R3AQ16821 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R3AQ16821 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R3AQ16821 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3AQ16821 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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