Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FSCN1Q16658 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FSCN1Q16658 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FSCN1Q16658 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FSCN1Q16658 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FSCN1Q16658 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms