Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LY6EQ16553 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LY6EQ16553 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LY6EQ16553 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LY6EQ16553 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LY6EQ16553 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LY6EQ16553 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LY6EQ16553 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LY6EQ16553 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms