Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALX1Q15699 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALX1Q15699 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ALX1Q15699 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALX1Q15699 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
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