Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MDC1Q14676 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MDC1Q14676 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MDC1Q14676 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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