Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2H3Q13889 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2H3Q13889 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H3Q13889 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H3Q13889 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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