Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP3B2Q13367 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AP3B2Q13367 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AP3B2Q13367 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP3B2Q13367 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP3B2Q13367 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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