Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DCLRE1C-205ENST00000378249 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.646e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-201ENST00000325844 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.76e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-209ENST00000378278 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-204ENST00000378246 2637 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.776e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.86e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-207ENST00000378255 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.816e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-205ENST00000558548 745 ntTSL 39.81□□□□□ -0.846e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-211ENST00000561262 726 ntTSL 29.36□□□□□ -0.916e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.976e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.457e-25■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 UNC45A-204ENST00000471780 1730 ntTSL 521.28■■□□□ 13e-11■■■■■ 51
PABPC4Q13310 UNC45A-207ENST00000487875 2641 ntTSL 216.25■□□□□ 0.193e-11■■■■■ 51
PABPC4Q13310 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-11■■■■■ 51
PABPC4Q13310 UNC45A-201ENST00000394275 4002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.483e-11■■■■■ 51
PABPC4Q13310 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 51
PABPC4Q13310 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.652e-22■■■■■ 50.9
PABPC4Q13310 TRIM33-206ENST00000492227 355 ntTSL 26.95□□□□□ -1.32e-22■■■■■ 50.9
PABPC4Q13310 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 PGLS-203ENST00000595782 651 ntTSL 321.83■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.883e-15■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 NECAB3-207ENST00000478237 827 ntTSL 227.14■■□□□ 1.949e-8■■■■■ 50.6
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PABPC4Q13310 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 523.57■■□□□ 1.369e-8■■■■■ 50.6
PABPC4Q13310 C21orf59-205ENST00000431599 417 ntTSL 313.76□□□□□ -0.219e-25■■■■■ 50.6
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PABPC4Q13310 RNF149-205ENST00000485752 621 ntTSL 57.17□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 GALNT1-203ENST00000589189 2346 ntTSL 58.19□□□□□ -1.12e-22■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.762e-22■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-11■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ 02e-11■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.988e-8■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.265e-8■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 PUSL1-205ENST00000493657 1783 ntTSL 225.21■■□□□ 1.639e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.469e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.745e-9■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.85e-25■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 215.88■□□□□ 0.135e-25■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 ASIC4-205ENST00000474489 2403 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.611e-19■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-19■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.281e-19■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.381e-9■■■■■ 49.5
PABPC4Q13310 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.785e-8■■■■■ 49.5
PABPC4Q13310 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 49.5
PABPC4Q13310 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.277e-9■■■■■ 49.5
PABPC4Q13310 TSSC2-202ENST00000526284 1244 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 49.4
PABPC4Q13310 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.852e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 TP53I13-202ENST00000378818 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.4■■□□□ 1.662e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 TP53I13-206ENST00000579674 2468 nt22■■□□□ 1.112e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 ADA-206ENST00000536532 1356 ntTSL 520.01■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.716e-22■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 ADA-202ENST00000464097 1770 ntTSL 217.68■□□□□ 0.422e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.26e-22■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 IRGQ-204ENST00000601520 495 ntTSL 315.29■□□□□ 0.042e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.026e-22■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 PABPC4-224ENST00000530186 352 ntTSL 28.86□□□□□ -0.992e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 IRGQ-202ENST00000596409 3752 nt6.18□□□□□ -1.422e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-13■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.291e-9■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.041e-9■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.91e-9■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.651e-7■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 EMP2-202ENST00000359543 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 GEMIN6-202ENST00000409011 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 49
PABPC4Q13310 ENTPD3-AS1-202ENST00000425156 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.577e-7■■■■■ 49
PABPC4Q13310 ENTPD3-AS1-203ENST00000439293 539 ntTSL 44.36□□□□□ -1.717e-7■■■■■ 49
PABPC4Q13310 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 ARID1B-211ENST00000635928 1551 ntTSL 514.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 OOEP-202ENST00000370363 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-27■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 OOEP-203ENST00000441145 964 ntTSL 312.79□□□□□ -0.362e-27■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.842e-27■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.326e-32■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 ATG10-209ENST00000514253 904 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 ATG10-205ENST00000508814 413 ntTSL 34.23□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 57.15□□□□□ -1.261e-323■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 PABPC1-206ENST00000518293 608 ntTSL 35.47□□□□□ -1.531e-323■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 ATOX1-204ENST00000522145 423 ntTSL 210.93□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 UBE2M-204ENST00000596985 349 ntTSL 39.38□□□□□ -0.915e-65■■■■■ 48.6
PABPC4Q13310 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-27■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.163e-27■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 RPS19-207ENST00000600467 420 ntTSL 225.22■■□□□ 1.632e-88■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 RPS19-205ENST00000598466 601 ntTSL 213.62□□□□□ -0.232e-88■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 RPS19-208ENST00000601492 342 ntTSL 510.12□□□□□ -0.792e-88■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 48.4
PABPC4Q13310 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.316e-17■■■■■ 48.3
PABPC4Q13310 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.086e-17■■■■■ 48.3
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