Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 EST3YIL009C-A 546 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 HPM1YIL110W 1134 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 CDC8YJR057W 651 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 SRT1YMR101C 1032 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 IFA38YBR159W 1044 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 YBR232CYBR232C 360 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 ARO10YDR380W 1908 nt8.97□□□□□ -0.97
TFB4Q12004 MPM1YJL066C 759 nt8.96□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YNL217WYNL217W 981 nt8.96□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 RRP36YOR287C 903 nt8.96□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 BRR1YPR057W 1026 nt8.96□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 CLB4YLR210W 1383 nt8.96□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 PCL2YDL127W 927 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YGL101WYGL101W 648 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 SPO16YHR153C 597 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YJL055WYJL055W 738 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 STP3YLR375W 1032 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 BLS1YLR408C 369 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YPR153WYPR153W 423 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 ERG24YNL280C 1317 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 SSU1YPL092W 1377 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 MEP3YPR138C 1470 nt8.95□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YDR042CYDR042C 603 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YFT2YDR319C 825 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 PHM8YER037W 966 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YMR187CYMR187C 1296 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 PHO23YNL097C 993 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 MFA2YNL145W 117 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YNL194CYNL194C 906 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 APM4YOL062C 1476 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 ALD5YER073W 1563 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 PRP40YKL012W 1752 nt8.94□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 MTQ2YDR140W 666 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YEA6YEL006W 1008 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YHR112CYHR112C 1137 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 RHO3YIL118W 696 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YLR365WYLR365W 333 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YOR325WYOR325W 474 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 LOA1YPR139C 903 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 RPN5YDL147W 1338 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 HFI1YPL254W 1467 nt8.93□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 RUF20RUF20 443 nt8.92□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 JNM1YMR294W 1122 nt8.92□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 PUP1YOR157C 786 nt8.92□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YBR027CYBR027C 333 nt8.92□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YPL136WYPL136W 369 nt8.92□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 snR37snR37 386 nt8.92□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 ERP2YAL007C 648 nt8.91□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YKR051WYKR051W 1257 nt8.91□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 IES2YNL215W 963 nt8.91□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 TOM71YHR117W 1920 nt8.91□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 PSD1YNL169C 1503 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 NSA1YGL111W 1392 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 SFL1YOR140W 2301 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YDR124WYDR124W 975 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 MRPL6YHR147C 645 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 TOA2YKL058W 369 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 PSY3YLR376C 729 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 YMR103CYMR103C 363 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 INP54YOL065C 1155 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 RIB7YBR153W 735 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 TPN1YGL186C 1740 nt8.9□□□□□ -0.98
TFB4Q12004 RPT5YOR117W 1305 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 PET18YCR020C 648 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 HIM1YDR317W 1245 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 PAU5YFL020C 369 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YIR043CYIR043C 693 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 MRPL49YJL096W 486 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 URA4YLR420W 1095 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 TAF13YML098W 504 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 GAL3YDR009W 1563 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 SAL1YNL083W 1485 nt8.89□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YPR084WYPR084W 1371 nt8.88□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 GLE1YDL207W 1617 nt8.88□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 GRX6YDL010W 696 nt8.88□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YIL086CYIL086C 309 nt8.88□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 POT1YIL160C 1254 nt8.88□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 MDM12YOL009C 816 nt8.88□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 POC4YPL144W 447 nt8.88□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 LEU2YCL018W 1095 nt8.88□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt8.87□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 NUC1YJL208C 990 nt8.87□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 MGM101YJR144W 810 nt8.87□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 ADE1YAR015W 921 nt8.87□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 SEC61YLR378C 1443 nt8.87□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 UFO1YML088W 2007 nt8.87□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 MSC1YML128C 1542 nt8.86□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 NMA2YGR010W 1188 nt8.86□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 ERG25YGR060W 930 nt8.86□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 SHY1YGR112W 1170 nt8.86□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YAL066WYAL066W 309 nt8.86□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt8.86□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YNR025CYNR025C 360 nt8.86□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 YOL106WYOL106W 354 nt8.86□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 SNU71YGR013W 1863 nt8.85□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 BUD26YDR241W 288 nt8.85□□□□□ -0.99
TFB4Q12004 COG2YGR120C 789 nt8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 112.3 ms