Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LOXL1Q08397 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LOXL1Q08397 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LOXL1Q08397 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms