Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAT1AQ00266 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAT1AQ00266 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAT1AQ00266 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAT1AQ00266 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms