Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CRB1P82279 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CRB1P82279 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CRB1P82279 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CRB1P82279 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CRB1P82279 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CRB1P82279 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CRB1P82279 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CRB1P82279 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CRB1P82279 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CRB1P82279 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CRB1P82279 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CRB1P82279 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CRB1P82279 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
CRB1P82279 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CRB1P82279 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CRB1P82279 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CRB1P82279 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CRB1P82279 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CRB1P82279 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CRB1P82279 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CRB1P82279 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CRB1P82279 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CRB1P82279 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CRB1P82279 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CRB1P82279 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CRB1P82279 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CRB1P82279 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CRB1P82279 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CRB1P82279 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CRB1P82279 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CRB1P82279 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CRB1P82279 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CRB1P82279 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CRB1P82279 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CRB1P82279 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CRB1P82279 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CRB1P82279 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CRB1P82279 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CRB1P82279 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CRB1P82279 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CRB1P82279 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CRB1P82279 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CRB1P82279 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CRB1P82279 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CRB1P82279 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CRB1P82279 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CRB1P82279 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CRB1P82279 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CRB1P82279 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CRB1P82279 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CRB1P82279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CRB1P82279 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CRB1P82279 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRB1P82279 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRB1P82279 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRB1P82279 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRB1P82279 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRB1P82279 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CRB1P82279 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CRB1P82279 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CRB1P82279 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CRB1P82279 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CRB1P82279 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CRB1P82279 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CRB1P82279 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CRB1P82279 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CRB1P82279 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CRB1P82279 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CRB1P82279 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CRB1P82279 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CRB1P82279 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CRB1P82279 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CRB1P82279 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CRB1P82279 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CRB1P82279 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CRB1P82279 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRB1P82279 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRB1P82279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRB1P82279 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRB1P82279 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRB1P82279 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CRB1P82279 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CRB1P82279 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CRB1P82279 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CRB1P82279 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CRB1P82279 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CRB1P82279 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CRB1P82279 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CRB1P82279 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CRB1P82279 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CRB1P82279 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CRB1P82279 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CRB1P82279 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CRB1P82279 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CRB1P82279 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CRB1P82279 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CRB1P82279 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CRB1P82279 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CRB1P82279 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms