Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPD1P62314 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRPD1P62314 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPD1P62314 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPD1P62314 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms