Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF3P57682 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF3P57682 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF3P57682 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF3P57682 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF3P57682 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF3P57682 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF3P57682 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF3P57682 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF3P57682 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF3P57682 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF3P57682 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF3P57682 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF3P57682 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF3P57682 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF3P57682 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF3P57682 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF3P57682 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF3P57682 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF3P57682 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF3P57682 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF3P57682 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF3P57682 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF3P57682 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF3P57682 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF3P57682 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF3P57682 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF3P57682 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF3P57682 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF3P57682 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF3P57682 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF3P57682 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF3P57682 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF3P57682 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF3P57682 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF3P57682 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF3P57682 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF3P57682 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF3P57682 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF3P57682 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF3P57682 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF3P57682 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF3P57682 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF3P57682 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF3P57682 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF3P57682 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF3P57682 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF3P57682 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF3P57682 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF3P57682 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF3P57682 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF3P57682 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF3P57682 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF3P57682 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF3P57682 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF3P57682 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF3P57682 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF3P57682 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF3P57682 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF3P57682 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF3P57682 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF3P57682 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF3P57682 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF3P57682 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF3P57682 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF3P57682 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF3P57682 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF3P57682 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF3P57682 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF3P57682 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF3P57682 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF3P57682 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF3P57682 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF3P57682 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF3P57682 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF3P57682 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF3P57682 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF3P57682 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF3P57682 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF3P57682 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF3P57682 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF3P57682 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLF3P57682 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF3P57682 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF3P57682 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLF3P57682 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF3P57682 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF3P57682 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF3P57682 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms