Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSCP56915 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSCP56915 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSCP56915 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSCP56915 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSCP56915 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSCP56915 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSCP56915 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSCP56915 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSCP56915 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSCP56915 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSCP56915 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSCP56915 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSCP56915 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSCP56915 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSCP56915 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSCP56915 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSCP56915 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSCP56915 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSCP56915 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSCP56915 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSCP56915 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSCP56915 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSCP56915 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSCP56915 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GSCP56915 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSCP56915 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSCP56915 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GSCP56915 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSCP56915 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSCP56915 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSCP56915 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GSCP56915 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSCP56915 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSCP56915 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GSCP56915 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSCP56915 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSCP56915 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSCP56915 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GSCP56915 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSCP56915 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GSCP56915 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GSCP56915 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSCP56915 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSCP56915 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSCP56915 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSCP56915 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSCP56915 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GSCP56915 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GSCP56915 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSCP56915 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSCP56915 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSCP56915 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSCP56915 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSCP56915 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSCP56915 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSCP56915 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSCP56915 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GSCP56915 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GSCP56915 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSCP56915 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSCP56915 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSCP56915 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GSCP56915 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSCP56915 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GSCP56915 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms