Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP6P55212 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP6P55212 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP6P55212 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP6P55212 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP6P55212 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP6P55212 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP6P55212 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP6P55212 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP6P55212 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP6P55212 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP6P55212 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP6P55212 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP6P55212 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP6P55212 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP6P55212 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP6P55212 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP6P55212 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP6P55212 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP6P55212 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP6P55212 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP6P55212 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP6P55212 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP6P55212 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP6P55212 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP6P55212 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP6P55212 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP6P55212 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP6P55212 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP6P55212 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP6P55212 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP6P55212 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP6P55212 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP6P55212 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP6P55212 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP6P55212 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP6P55212 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP6P55212 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP6P55212 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP6P55212 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP6P55212 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP6P55212 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP6P55212 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP6P55212 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP6P55212 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP6P55212 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP6P55212 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP6P55212 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP6P55212 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP6P55212 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP6P55212 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP6P55212 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP6P55212 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP6P55212 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP6P55212 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP6P55212 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP6P55212 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP6P55212 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP6P55212 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP6P55212 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP6P55212 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP6P55212 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP6P55212 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP6P55212 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP6P55212 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP6P55212 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP6P55212 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP6P55212 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP6P55212 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP6P55212 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP6P55212 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP6P55212 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP6P55212 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP6P55212 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP6P55212 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP6P55212 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP6P55212 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP6P55212 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP6P55212 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP6P55212 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP6P55212 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP6P55212 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP6P55212 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP6P55212 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP6P55212 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP6P55212 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP6P55212 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP6P55212 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP6P55212 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP6P55212 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP6P55212 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP6P55212 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms