Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
EPHB4P54760 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPHB4P54760 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB4P54760 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB4P54760 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms