Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP1B3P54709 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1B3P54709 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP1B3P54709 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP1B3P54709 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B3P54709 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B3P54709 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B3P54709 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B3P54709 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B3P54709 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B3P54709 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP1B3P54709 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP1B3P54709 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B3P54709 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B3P54709 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B3P54709 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP1B3P54709 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B3P54709 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B3P54709 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B3P54709 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B3P54709 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B3P54709 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP1B3P54709 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B3P54709 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B3P54709 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B3P54709 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP1B3P54709 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B3P54709 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B3P54709 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B3P54709 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B3P54709 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP1B3P54709 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP1B3P54709 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms