Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A3P53794 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC5A3P53794 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A3P53794 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A3P53794 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A3P53794 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms