Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSNK1DP48730 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSNK1DP48730 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSNK1DP48730 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSNK1DP48730 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSNK1DP48730 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms