Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX9P48436 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX9P48436 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX9P48436 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX9P48436 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX9P48436 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX9P48436 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX9P48436 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX9P48436 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX9P48436 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX9P48436 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX9P48436 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX9P48436 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX9P48436 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX9P48436 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX9P48436 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX9P48436 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOX9P48436 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX9P48436 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX9P48436 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX9P48436 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX9P48436 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX9P48436 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX9P48436 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX9P48436 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX9P48436 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX9P48436 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX9P48436 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX9P48436 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX9P48436 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX9P48436 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX9P48436 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX9P48436 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX9P48436 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX9P48436 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX9P48436 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX9P48436 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX9P48436 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX9P48436 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX9P48436 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX9P48436 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOX9P48436 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX9P48436 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX9P48436 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX9P48436 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX9P48436 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX9P48436 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX9P48436 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX9P48436 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX9P48436 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX9P48436 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX9P48436 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX9P48436 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX9P48436 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX9P48436 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX9P48436 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX9P48436 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX9P48436 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX9P48436 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX9P48436 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX9P48436 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX9P48436 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX9P48436 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX9P48436 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX9P48436 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX9P48436 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX9P48436 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX9P48436 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX9P48436 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX9P48436 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX9P48436 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX9P48436 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX9P48436 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX9P48436 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX9P48436 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX9P48436 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX9P48436 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX9P48436 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX9P48436 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX9P48436 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX9P48436 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX9P48436 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX9P48436 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX9P48436 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX9P48436 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX9P48436 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX9P48436 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX9P48436 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX9P48436 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX9P48436 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX9P48436 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX9P48436 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX9P48436 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX9P48436 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX9P48436 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX9P48436 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX9P48436 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX9P48436 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX9P48436 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX9P48436 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms