Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A3P43003 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A3P43003 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A3P43003 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms