Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP8P40818 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP8P40818 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP8P40818 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP8P40818 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP8P40818 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP8P40818 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP8P40818 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP8P40818 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP8P40818 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP8P40818 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP8P40818 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP8P40818 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP8P40818 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP8P40818 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP8P40818 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP8P40818 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP8P40818 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP8P40818 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP8P40818 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP8P40818 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP8P40818 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP8P40818 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP8P40818 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP8P40818 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP8P40818 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP8P40818 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP8P40818 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP8P40818 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP8P40818 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP8P40818 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP8P40818 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP8P40818 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP8P40818 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP8P40818 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP8P40818 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP8P40818 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP8P40818 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP8P40818 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP8P40818 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP8P40818 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP8P40818 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP8P40818 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP8P40818 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP8P40818 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP8P40818 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP8P40818 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP8P40818 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP8P40818 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP8P40818 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP8P40818 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP8P40818 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP8P40818 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP8P40818 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP8P40818 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP8P40818 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP8P40818 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP8P40818 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP8P40818 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP8P40818 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP8P40818 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP8P40818 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP8P40818 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP8P40818 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP8P40818 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP8P40818 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP8P40818 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP8P40818 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP8P40818 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP8P40818 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP8P40818 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP8P40818 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP8P40818 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP8P40818 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP8P40818 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP8P40818 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP8P40818 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP8P40818 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms