Protein–RNA interactions for Protein: P40453

UBP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,071 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP7P40453 TRR2YHR106W 1029 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP7P40453 DAL80YKR034W 810 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP7P40453 PUS4YNL292W 1212 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP7P40453 ATG22YCL038C 1587 nt7.37□□□□□ -1.23
UBP7P40453 AFG2YLR397C 2343 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP7P40453 AIM46YHR199C 933 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP7P40453 YJL213WYJL213W 996 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP7P40453 PET10YKR046C 852 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP7P40453 VPS65YLR322W 315 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP7P40453 ZIM17YNL310C 525 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP7P40453 YPC1YBR183W 951 nt7.36□□□□□ -1.23
UBP7P40453 ECM10YEL030W 1935 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP7P40453 GTS1YGL181W 1191 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP7P40453 GUT1YHL032C 2130 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP7P40453 YHC3YJL059W 1227 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP7P40453 TCB1YOR086C 3561 nt7.35□□□□□ -1.23
UBP7P40453 YOR111WYOR111W 699 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP7P40453 HNM1YGL077C 1692 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP7P40453 NAF1YNL124W 1479 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP7P40453 YPQ2YDR352W 954 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP7P40453 PAM17YKR065C 594 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP7P40453 YIL108WYIL108W 2091 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP7P40453 TPI1YDR050C 747 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP7P40453 LGE1YPL055C 999 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP7P40453 DML1YMR211W 1428 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP7P40453 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP7P40453 FLC2YAL053W 2352 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP7P40453 SNF7YLR025W 723 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP7P40453 ERV25YML012W 636 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP7P40453 NDE1YMR145C 1683 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP7P40453 CCW12YLR110C 402 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP7P40453 CAR2YLR438W 1275 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP7P40453 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP7P40453 snR30snR30 606 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP7P40453 YNL040WYNL040W 1371 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP7P40453 CAN1YEL063C 1773 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP7P40453 DPH5YLR172C 903 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP7P40453 SML1YML058W 315 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP7P40453 SPE3YPR069C 882 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP7P40453 CIT2YCR005C 1383 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP7P40453 NFS1YCL017C 1494 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP7P40453 PLB3YOL011W 2061 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP7P40453 PDA1YER178W 1263 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP7P40453 RTC4YNL254C 1206 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP7P40453 ERG10YPL028W 1197 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP7P40453 RFS1YBR052C 633 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP7P40453 ENB1YOL158C 1821 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP7P40453 MSS51YLR203C 1311 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP7P40453 RTC2YBR147W 891 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP7P40453 MPH3YJR160C 1809 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP7P40453 DAL7YIR031C 1665 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP7P40453 KDX1YKL161C 1302 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP7P40453 TUB1YML085C 1344 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP7P40453 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP7P40453 BIO3YNR058W 1443 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP7P40453 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP7P40453 YLR162WYLR162W 357 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP7P40453 PUS5YLR165C 765 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP7P40453 HAL5YJL165C 2568 nt7.21□□□□□ -1.25
UBP7P40453 YGL260WYGL260W 231 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP7P40453 ARO7YPR060C 771 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YCL049CYCL049C 939 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP7P40453 HXT13YEL069C 1695 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP7P40453 RBS1YDL189W 1374 nt7.2□□□□□ -1.26
UBP7P40453 PPS1YBR276C 2424 nt7.2□□□□□ -1.26
UBP7P40453 FCP1YMR277W 2199 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP7P40453 LOT6YLR011W 576 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP7P40453 LDB7YBL006C 543 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YAH1YPL252C 519 nt7.19□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YKL147CYKL147C 618 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP7P40453 SRY1YKL218C 981 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP7P40453 GET4YOR164C 939 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YPR130CYPR130C 408 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP7P40453 FCY2YER056C 1602 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP7P40453 MPE1YKL059C 1326 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP7P40453 ERG24YNL280C 1317 nt7.18□□□□□ -1.26
UBP7P40453 COX15YER141W 1461 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP7P40453 CIT3YPR001W 1461 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP7P40453 PET117YER058W 324 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP7P40453 DPM1YPR183W 804 nt7.17□□□□□ -1.26
UBP7P40453 AFG3YER017C 2286 nt7.16□□□□□ -1.26
UBP7P40453 MAK32YCR019W 1092 nt7.16□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YDR327WYDR327W 327 nt7.16□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YJL163CYJL163C 1668 nt7.16□□□□□ -1.26
UBP7P40453 SNF4YGL115W 969 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP7P40453 FHN1YGR131W 525 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP7P40453 RMA1YKL132C 1293 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YOL046CYOL046C 675 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YOR012WYOR012W 414 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP7P40453 LIP5YOR196C 1245 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP7P40453 SRF1YDL133W 1314 nt7.15□□□□□ -1.26
UBP7P40453 YPL277CYPL277C 1464 nt7.15□□□□□ -1.27
UBP7P40453 NUP57YGR119C 1626 nt7.15□□□□□ -1.27
UBP7P40453 CIA1YDR267C 993 nt7.14□□□□□ -1.27
UBP7P40453 APE4YHR113W 1473 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP7P40453 YCR041WYCR041W 333 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP7P40453 URH1YDR400W 1023 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP7P40453 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP7P40453 HTZ1YOL012C 405 nt7.13□□□□□ -1.27
UBP7P40453 FIT2YOR382W 462 nt7.13□□□□□ -1.27
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