Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXN2P32314 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXN2P32314 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXN2P32314 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXN2P32314 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXN2P32314 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXN2P32314 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXN2P32314 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXN2P32314 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXN2P32314 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXN2P32314 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms