Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTX1P32242 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX1P32242 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX1P32242 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OTX1P32242 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX1P32242 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX1P32242 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX1P32242 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX1P32242 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX1P32242 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OTX1P32242 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX1P32242 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX1P32242 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX1P32242 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX1P32242 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OTX1P32242 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX1P32242 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX1P32242 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX1P32242 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
OTX1P32242 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX1P32242 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX1P32242 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX1P32242 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX1P32242 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX1P32242 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX1P32242 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX1P32242 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OTX1P32242 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX1P32242 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTX1P32242 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTX1P32242 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX1P32242 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX1P32242 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX1P32242 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OTX1P32242 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX1P32242 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX1P32242 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX1P32242 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX1P32242 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX1P32242 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX1P32242 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX1P32242 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTX1P32242 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX1P32242 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX1P32242 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX1P32242 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX1P32242 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX1P32242 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX1P32242 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTX1P32242 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX1P32242 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX1P32242 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX1P32242 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX1P32242 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTX1P32242 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX1P32242 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX1P32242 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTX1P32242 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX1P32242 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX1P32242 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX1P32242 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX1P32242 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX1P32242 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX1P32242 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX1P32242 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTX1P32242 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTX1P32242 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
OTX1P32242 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTX1P32242 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTX1P32242 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX1P32242 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX1P32242 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX1P32242 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX1P32242 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX1P32242 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX1P32242 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OTX1P32242 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTX1P32242 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX1P32242 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX1P32242 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTX1P32242 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms