Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDUFS1P28331 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDUFS1P28331 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDUFS1P28331 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDUFS1P28331 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDUFS1P28331 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms