Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLS3P13797 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLS3P13797 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLS3P13797 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLS3P13797 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLS3P13797 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLS3P13797 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLS3P13797 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLS3P13797 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLS3P13797 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLS3P13797 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLS3P13797 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLS3P13797 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLS3P13797 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLS3P13797 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLS3P13797 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLS3P13797 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLS3P13797 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLS3P13797 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLS3P13797 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLS3P13797 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLS3P13797 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLS3P13797 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLS3P13797 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLS3P13797 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLS3P13797 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLS3P13797 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PLS3P13797 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLS3P13797 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLS3P13797 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLS3P13797 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLS3P13797 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLS3P13797 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLS3P13797 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PLS3P13797 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PLS3P13797 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLS3P13797 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLS3P13797 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLS3P13797 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLS3P13797 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLS3P13797 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PLS3P13797 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLS3P13797 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLS3P13797 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PLS3P13797 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PLS3P13797 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PLS3P13797 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS3P13797 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS3P13797 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS3P13797 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS3P13797 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS3P13797 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLS3P13797 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLS3P13797 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLS3P13797 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLS3P13797 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLS3P13797 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PLS3P13797 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLS3P13797 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLS3P13797 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLS3P13797 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLS3P13797 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLS3P13797 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PLS3P13797 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLS3P13797 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLS3P13797 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLS3P13797 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS3P13797 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS3P13797 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLS3P13797 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLS3P13797 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLS3P13797 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS3P13797 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS3P13797 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS3P13797 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS3P13797 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLS3P13797 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLS3P13797 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PLS3P13797 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLS3P13797 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PLS3P13797 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLS3P13797 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLS3P13797 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLS3P13797 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLS3P13797 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLS3P13797 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLS3P13797 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS3P13797 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS3P13797 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLS3P13797 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms