Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP1P11387 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP1P11387 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP1P11387 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP1P11387 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP1P11387 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP1P11387 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOP1P11387 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP1P11387 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOP1P11387 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP1P11387 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP1P11387 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP1P11387 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TOP1P11387 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP1P11387 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP1P11387 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TOP1P11387 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP1P11387 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TOP1P11387 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP1P11387 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP1P11387 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP1P11387 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP1P11387 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TOP1P11387 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP1P11387 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP1P11387 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP1P11387 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP1P11387 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TOP1P11387 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP1P11387 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP1P11387 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP1P11387 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TOP1P11387 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP1P11387 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP1P11387 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TOP1P11387 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP1P11387 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP1P11387 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP1P11387 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TOP1P11387 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP1P11387 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP1P11387 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP1P11387 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOP1P11387 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP1P11387 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP1P11387 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP1P11387 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP1P11387 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP1P11387 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP1P11387 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP1P11387 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP1P11387 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP1P11387 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP1P11387 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP1P11387 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP1P11387 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP1P11387 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP1P11387 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP1P11387 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP1P11387 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP1P11387 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TOP1P11387 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP1P11387 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP1P11387 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP1P11387 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP1P11387 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP1P11387 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP1P11387 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP1P11387 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP1P11387 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP1P11387 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP1P11387 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP1P11387 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP1P11387 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1P11387 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1P11387 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1P11387 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1P11387 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1P11387 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1P11387 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP1P11387 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP1P11387 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP1P11387 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP1P11387 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP1P11387 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP1P11387 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP1P11387 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP1P11387 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP1P11387 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP1P11387 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP1P11387 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP1P11387 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP1P11387 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP1P11387 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP1P11387 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP1P11387 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP1P11387 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP1P11387 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP1P11387 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP1P11387 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms