Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDGFRBP09619 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDGFRBP09619 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDGFRBP09619 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDGFRBP09619 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFRBP09619 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFRBP09619 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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